Новости

 
14 декабря 2020 г.

Специалисты создали программу, которая позволяет анализировать геном с помощью iPhone. В сочетании с миниатюрным прибором для секвенирования ДНК и РНК гаджет превращается в карманную генетическую лабораторию.

Новое приложение позволяет анализировать ДНК на обычном смартфоне.

Новое приложение позволяет анализировать ДНК на обычном смартфоне.

Удивительная разработка описана в научной статье, опубликованной в журнале Gigascience.

Технологии секвенирования ("чтения") ДНК и РНК развиваются стремительно. Ещё несколько лет назад новинкой были секвенаторы, весящие меньше трёх килограммов. Сегодня же компания Oxford Nanopore предлагает устройство, которое умещается в ладони и весит менее ста граммов.

Однако секвенатор выполняет только биохимическую ("мокрую") часть расшифровки генома. Полученные на нём данные нужно обработать, и эта обработка требует внушительного количества вычислений. Ещё недавно для этого нужен был как минимум высокопроизводительный ноутбук, а то и целый сервер.

Теперь же нужные расчёты может выполнить обычный смартфон. Правда, пока новая программа доступна лишь для пользователей iPhone. Тестирование на множестве геномов показало, что по производительности она сравнима с популярными среди специалистов аналогами, работающими на "больших" устройствах.

Разработчик приложения iGenomics Асприн Палатник держит в руках карманную генетическую лабораторию: в правой -iPhone, а в левой - секвенатор генома.

Разработчик приложения iGenomics Асприн Палатник держит в руках карманную генетическую лабораторию: в правой – iPhone, а в левой – секвенатор генома.

Пользователю требуется лишь установить бесплатное приложение iGenomics и подключиться к секвенатору по беспроводной связи.

Разработчики подчёркивают, что все вычисления выполняются исключительно на самом гаджете, а не на удалённых серверах. Поэтому iGenomics может работать даже без доступа к Интернету.

Имея карманный секвенатор и iPhone с установленным на нём iGenomics, биолог практически носит с собой генетическую лабораторию. Это означает, что он может заниматься чтением генетических данных в любом уголке земного шара.

К слову, это особенно важно для оперативной борьбы с вирусами, в том числе и SARS-CoV-2. Разработчики даже опубликовали онлайн-руководство по расшифровке геномов вирусов.

Приложение iGenomics имеет открытый исходный код. Так что в скором будущем можно ожидать выхода таких же программ, работающих на других гаджетах.

Источник: ВЕСТИ НАУКА

Есть вопрос или комментарий?..


Ваше имя Электронная почта
Получать почтовые уведомления об ответах:

| Примечание. Сообщение появится на сайте после проверки модератором.


Вернуться в раздел Новости

Регистрация ЛСCRO Биоконсалтинг предлагает любые виды услуг по юридическому оформлению лекарственных средств на территории РФ....
Открыть раздел Регистрация ЛС
Подработка для студентов! Участие в медицинских-научных исследованиях. Исследования проводятся в течении 4-х дней (2+2 через 2 недели) (оплата от 3 000 рублей в день)....
Открыть раздел Вакансии
Политика в области качестваОсновная цель деятельности Общество с ограниченной ответственностью «Биоконсалтинг» (далее ООО «Биоконсалтинг») – проведение токсикологических,...
Открыть раздел Политика в области качества
The LineAct Platform